开发区位于南京市东北郊，拥有82公里长江黄金岸线，紧邻长江二桥、新生圩外贸港和龙潭深水港，分为新港片区和开发区东区。
新港片区于1992年起步发展，区内设有工业、保税仓储、金融贸易和综合服务4个功能区，现已形成电子信息、生物医药、轻工机械和新材料等四大特色产业，建成为工业布局合理、产业特色凸显、创新能力突出的现代化高科技产业园区，现已有20多个国家和地区的400多家外资企业进区，投资总额超过80亿美元。
开发区东区于2009年1月成立，由栖霞经济开发区、龙潭物流园、三江口工业园和仙林高科技产业园4个省市级园区组建而成，依托龙潭深水港作为长江流域江海联运的重要枢纽地位，以及仙林新市区城市功能、科教资源优势，将重点发展电子信息、医药食品、装备制造、环保新能源、现代服务业五大产业。
开发区所依托的栖霞区面积340平方公里，拥有沿江岸线84公里，是南京重要的石化、汽车、电子、建材工业区和企业、资金、人才、技术密集区，为开发区发展提供了广阔的腹地。与开发区毗邻的仙林大学城面积47平方公里，由大学集中区、科技产业区和高档生活区组成，环境优美，文化氛围浓厚，拥有众多高等院校、科研机构和其他文化事业团体，是现代信息传播平台和国内最大的数码港之一，为开发区提供了强大的人才和智力支持。
建区以来，开发区已累计引进来自20多个国家和地区的400多个外资项目，投资总额达到90亿美元，实际利用外资29亿美元。韩国LG，日本夏普、富士通，德国博世、西门子，美国邦基、汉佰等世界500强在区内投资企业44家。在大力引进外资发展外向型经济的同时，开发区还积极承接南京城区的工业转移，同步发展国有和民营经济。中国电子、紫金电子、长江电子、华东电子、江南光电、金陵药业、凤凰传媒等国有大企业集团以及圣和药业、佳通手机、大贺传媒等民营科技企业纷纷在开发区投资建厂，区内共有投资超亿元的内资企业39家。
2010年，开发区实现地区生产总值330亿元，增长24.3%；地方一般预算收入12亿元，增长21.3%；全社会固定资产投资162亿元，工业固定资产投资148亿元，分别增长220%和208%；外贸出口40亿美元，增长28.4%。目前，开发区平均每亩工业用地投资强度60万美元，每平方公里工业用地实现工业产值超过200亿元，发展效率处于全国国家级开发区前列。
开发区在商务部国家级经济技术开发区综合投资环境评比中名列前茅。并已连续数年被省、市评为“先进开发区”、“建设新南京有功单位”和“外向型经济工作优胜单位”。